Sämtliche Einstellungen von Fluxbox können in der Datei ~/.fluxbox/init bearbeitet werden. Nach dem Bearbeiten und Speichern mit einem beliebigen Texteditor können die neuen Einstellungen mit reconfigure (reload config) oder restart aus dem Fluxboxmenü geladen werden.
Alle möglichen Einstellungen mit Beschreibung:
(Aus der neuen man page): screen0 am Anfang bedeutet, dass diese Einstellungen nur für den ersten Bildschirm (Xinerama) angewendet werden. Für weitere Bildschirme kann screen1, screen2 etc. verwendet werden.
session.screen0.menu.alpha: session.screen0.slit.alpha: session.screen0.toolbar.alpha: session.screen0.window.focus.alpha: session.screen0.window.unfocus.alpha:      Mit diesen Zeilen kann die Transparenz der einzelnen      Fluxboxkomponenten angepasst werden. Der Wert ist dabei     eine Ganzzahl zwischen 0 und 255, wobei 0 vollständig     transparent und 255 deaktivierte Transparenz bedeutet.      Standardwert: 255
session.screen0.slit.autoHide: session.screen0.toolbar.autoHide:   Mit diesen Einstellungen kann man bewirken, dass  toolbar oder slit bei Nichtgebrauch automatisch ausgeblendet werden.  Der Wert ist dabei true (aktiviert) oder false (ständig sichtbar)        Standardwert: false
session.screen0.desktopwheeling: session.screen0.toolbar.wheeling:    Sind diese Einstellungen aktiviert (true) kann mit dem    Mausrad zwischen den Arbeitsflächen umgeschaltet werden,    entweder wenn sich die Maus über einem freien Desktopbereich   (desktopwheeling) oder über der toolbar (toolbar.wheeling) befindet.      Standardwert: true
session.screen0.slit.layer: session.screen0.toolbar.layer:     Ebene auf der sich Slit und Toolbar befinden     Standardwert: Desktop
session.screen0.slit.onTop: session.screen0.toolbar.onTop:     Werden diese Einstellungen aktiviert befinden sich     toolbar/slit immer oberhalb aller anderer Fenster    Standardwert: False
session.screen0.slit.placement: session.screen0.toolbar.placement:      Standort von Toolbar und Slit. Mögliche Optionen sind:      -   BottomCenter    Unten zentriert     -   BottomLeft      Unten links     -   BottomRight     Unten rechts     -   LeftCenter      Links zentriert     -   RightCenter     Rechts zentriert     -   TopCenter       Oben zentriert     -   TopLeft         Oben links     -   TopRight        Oben rechts
session.screen0.slit.maxOver: session.screen0.toolbar.maxOver:      Sind diese Einstellungen aktiviert überdecken     maximierte Fenster die Toolbar / den Slit.       Standardwert: false
session.screen0.toolbar.height:      Hier kann die Höhe der Toolbar eingestellt werden.      Wird sie auf 0 gesetzt bestimmt der verwendete     Stil wie hoch sie ist     Standardwert: 0
session.screen0.toolbar.visible:      Wird diese Option deaktiviert (false) ist die     toolbar komplett ausgeblendet     Standardwert: true
session.screen0.toolbar.widthPercent:      Die Breite der Toolbar, angegeben in Prozent der Bildschirmbreite     Standardwert: 100
session.screen0.toolbar.tools:      Definiert welche Werkzeuge die Toolbar zur Verfügung stellen soll.     Mehr dazu steht im Abschnitt Toolbar in der manpage.      Mögliche Auswahl:     -   clock   (uhr)     -   iconbar  (Fensterleiste)     -   nextwindow  (nächstes Fenster)     -   prevwindow  (vorheriges Fenster)     -   nextworkspace  (nächste Arbeitsfläche)     -   prevworkspace (vorherige Arbeitsfläche)     -   systemtray  (Systemabschnitt)     -   workspacename  (Name der Arbeitsfläche)
session.screen0.slit.onhead: session.screen0.toolbar.onhead:      Bestimmt bei Systemen mit mehreren Monitoren auf welchem      sich die Toolbar / der Slit befinden     Standardwert: 0session.screen0.slit.direction: Vertical     Ausrichtung des Slits, Horizontal oder Vertikal
session.screen0.iconbar.iconWidth: 70session.screen0.iconbar.mode:      Welche Fenster sollen in der Fensterleiste angezeigt werden?     -   All Windows  (alle)     -   Icons  (minimierte)     -   None  (keine)     -   Workspace  (alle der aktuellen Arbeitsfläche)     -   WorkspaceIcons  (alle minimierten der aktuellen Arbeitsfläche)
session.screen0.iconbar.usePixmap:      Sollen Icons in der Fensterleiste angezeigt werden?     Ja (true) oder nein (false)     Standardwert: true
session.screen0.iconbar.iconTextPadding: 10lsession.screen0.iconbar.deiconifyMode: Currentsession.screen0.iconbar.wheelMode: Screensession.screen0.iconbar.alignment:      Anordnung der Einträge in der Fensterleiste     Available options:      -   Left: Feste Breite, linksbündig      -   Relative: flexible Breite      -   Right: Feste Breite, rechtsbündig     Standardwert: Relative
session.screen0.overlay.lineWidth: 1session.screen0.overlay.lineStyle: LineSolidsession.screen0.overlay.joinStyle: JoinMitersession.screen0.overlay.capStyle: CapNotLast
session.screen0.tab.alignment: Left     Anordnung der Reiter (tabs)session.screen0.tab.height: 16     Höhe der Reiter (tabs)session.screen0.tab.placement: Topsession.screen0.tab.rotatevertical: Truesession.screen0.tab.width: 64     Breite der Reiter (tabs)
session.screen0.edgeSnapThreshold:      Magneteffekt, damit Fenster sich an anderen oder an      den Seitenrändern festkleben. Die Zahl gibt den Abstand     an ab dem dieser Effekt aktiviert wird     Standardwert: 0
session.screen0.followModel: Ignoresession.screen0.rowPlacementDirection: LeftToRightsession.screen0.colPlacementDirection: TopToBottomsession.screen0.resizeMode: Bottomsession.screen0.focusModel: ClickToFocussession.screen0.autoRaise: session.screen0.clickRaises: session.screen0.workspacewarping:      Ist diese Option aktiviert können Fenster auf eine     andere Arbeitsfläche gezogen werden.      Standardwert: truesession.screen0.showwindowposition:      Ist diese Option aktiviert wird beim Verschieben / Vergrössern     eines Fensters die momentane Position / Grösse in Form      von  x / y eingeblendet     Standardwert: true
session.screen0.decorateTransient: session.screen0.showposinsidewindow: session.screen0.menuMode: Delaysession.screen0.focusNewWindows: session.screen0.workspaceNames: workspace1, workspaceN     Standardwert: one, two, three, four
session.screen0.menuDelayClose: 0session.screen0.strftimeFormat:      Format der Uhr in der Toolbar. Näheres dazu in der manpage von strftime(3)     Standardwert: %I:%M %p    
session.screen0.windowPlacement:      Diese Option gibt an wie Fluxbox neue Fenster automatisch platzieren soll     RowSmartPlacement reiht die Fenster ueberlappend auf,     ColSmartPlacement reiht sie ohne Ueberlappung nebeneinander,     CascadePlacement setzt es unter den Fenstertitel des letzten Fensters,      UnderMousePlacement setzt sie unter die aktuelle Mausposition     Standardwert: RowSmartPlacement
session.screen0.rowPlacementDirection: LeftToRight|RightToLeftsession.screen0.colPlacementDirection: TopToBottom|BottomToTop     Setzt die Richtung in der Fluxbox neue Fenster bei      RowSmartPlacement respektive ColSmartPlacement setzen soll.
session.screen0.fullMaximization: session.screen0.sloppywindowgrouping: session.screen0.rootCommand: 
session.screen0.imageDither: 
session.screen0.menuDelay: session.screen0.workspaces:      Anzahl Arbeitsflächen     Standardwert: 4
session.screen0.focusLastWindow: session.screen0.windowMenu:
session.appsFile: session.groupFile: session.keyFile: session.menuFile: session.slitlistFile: session.styleFile:      Standort der Konfigurationsdateien. Normalerweise werden     die Dateien im ~/.fluxbox Verzeichnis abgelegt / verwendet 
session.autoRaiseDelay: 
session.cacheLife: 
session.cacheMax:      
session.colorsPerChannel:    session.doubleClickInterval:      Abstand (in Millisekunden) zwischen zwei Mausklicks damit     diese noch als Doppelklick gewertet werden     Standardwert: 250
session.forcePseudoTransparency: session.focusTabMinWidth: 0session.iconbar: 
session.ignoreBorder: session.imageDither: 
session.numLayers: 13session.opaqueMove:      Anzeigen des Inhalts beim Verschieben eines Fensters.      Sollte auf langsamen Systemen deaktiviert (false) werden     Standardwert: true
session.tabs: session.tabPadding: 0session.tabsAttachArea: Window
session.titlebar.left: Sticksession.titlebar.right: Minimize Maximize Close     Welche Knöpfe sollen im Fenstertitel angezeigt werden,      in welcher Reihenfolge und auf welcher Seite.      Auswahl:      Stick  Klebezustand     Menu  Fenstermenü     Shade  Auf/Abrollen     Minimize  Minimieren     Maximize  Maximieren     Close.  Schliessen
session.updateDelayTime: 0session.useMod1: